Nadležno tijelo sustava za osiguranje kvalitete na EFFECTUS-u je Odbor za kvalitetu. Odbor djeluje u koordinaciji s ostalim tijelima i službama EFFECTUS-a, a odgovoran je za osiguranje i unaprjeđenje kvalitete u svim područjima djelovanja EFFECTUS-a. Odbor ujedinjuje i koordinira sve aktivnosti vezane za kvalitetu te ima slobodu prilagodbe postupaka sustava za kvalitetu sukladno potrebama EFFECTUS-a.
Odbor ima 13 članova. Radom Odbora rukovodi voditelj Odbora kojeg imenuje Stručno vijeće na neodređeno vrijeme, do razrješenja. Uz voditelja Odbora, članovi Odbora su:
- dekan
- prodekan za nastavu i studijske programe
- tajnik
- voditelj Službe za podršku studentima i nastavnicima
- voditelj Centra za međunarodnu suradnju
- voditelj Centra karijera
- voditelj Centra za istraživanje i razvoj
- voditelj Znanstvenog centra
- savjetnik za studente
- predstavnik studenata
- predstavnik Alumnija EFFECTUS-a
- predstavnik gospodarske zajednice ili eksperata za pitanje osiguranja i unapređivanja kvalitete u visokom obrazovanju.
Članove Odbora imenuje Stručno vijeće posebnom odlukom.