EFFECTUS-om upravlja Upravno vijeće.
Upravno vijeće obavlja poslove određene Zakonom, podzakonskim aktima i Statutom Effectus-a, a osobito:
- utvrđuje razvojnu politiku EFFECTUS-a,
- donosi program rada i strategiju razvoja EFFECTUS-a i nadzire njihovo izvršavanje,
- brine o zakonitosti rada EFFECTUS-a, racionalnoj uporabi materijalnih i kadrovskih resursa,
- brine o kontinuiranom rastu kvalitete u skladu s nacionalnim i međunarodnim standardima,
- utvrđuje financijsku politiku EFFECTUS-a i donosi financijske planove,
- predlaže osnivaču promjenu ili proširenje djelatnosti,
- donosi Statut na prijedlog Stručnog vijeća, a uz suglasnost osnivača,
- donosi odluke u drugom stupnju o ostvarivanju pojedinačnih prava radnika,
- donosi Pravilnik o unutarnjem ustrojstvu i druge opće akte iz svoje nadležnosti,
- određuje osobe ovlaštene za potpisivanje financijske dokumentacije,
- daje suglasnost na pojedine odluke dekana, glavnog direktora i Stručnog vijeća sukladno Statutu,
- daje osnivačima, dekanu i glavnom direktoru prijedloge i mišljenja o pojedinim pitanjima,
- bira i razrješava dekana u skladu sa Statutom,
- obavlja druge poslove utvrđene Zakonom, podzakonskim aktima i Statutom.
